Label Free蛋白质质谱

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Label free非标定量蛋白质组学


实验介绍

蛋白质质谱是大规模、高通量地研究一个细胞、组织或物种中表达的全套蛋白质的学科。可以对各种类型的蛋白样本进行质谱鉴定,全面快速获得细胞、组织或者完整生物个体的蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态等。用于研究蛋白质之间的相互作用与联系,在整体水平上研究蛋白质的组成与调控活动规律。

Label-free是一种非标记的定量蛋白质组学技术,不需使用同位素标签做内部标准,直接根据肽段质谱峰的强度对蛋白进行相对定量。常用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组各类样品中蛋白质表达水平的差异,发现生物标记物等。


蛋白质组学应用

功能

应用领域

蛋白质鉴定

哪些蛋白质在特定的细胞类型、组织或整个生物体中正常表达,或者哪些蛋白质的表达有差异?

个性化医疗

根据每个病人的基因和表观遗传构成,为其量身定制疾病治疗,以提高疗效,减少不良反应。虽然到目前为止,基因组学和转录组学是此类研究的主要焦点,但蛋白质组学数据可能会进一步增加针对患者的管理维度。

蛋白质定量

测量总的(稳态)蛋白质丰度,以及调查蛋白质的周转率(即,蛋白质在产生和降解之间的循环速度)。

生物标志物的发现

鉴定蛋白质标记物,例如,胶质母细胞瘤的诊断和预后,以及评估患者对治疗干预的反应,如干细胞移植。

蛋白质的定位

蛋白质在哪里表达和/或积累与表达时间一样对蛋白质的功能至关重要,因为细胞定位控制着哪些分子相互作用的伙伴和目标可以使用。

药物发现和开发

识别潜在的药物靶点,检查选定的蛋白质靶点的可药性,开发针对候选治疗性蛋白质靶点的药物(例如,针对肝细胞癌)。

翻译后修饰

蛋白质在哪里表达和/或积累与表达时间一样对蛋白质的功能至关重要,因为细胞定位控制着哪些分子相互作用的伙伴和目标可以使用。

系统生物学

识别潜在的药物靶点,检查选定的蛋白质靶点的可药性,开发针对候选治疗性蛋白质靶点的药物(例如,针对肝细胞癌)。

功能性蛋白质组学

这一领域的蛋白质组学侧重于确定特定的单个蛋白质、一类蛋白质(如激酶)或整个蛋白质互动网络的生物功能。

农业

研究植物与病原体之间的相互作用,提高作物对洪水、干旱和其他环境压力的抵抗力的工程。

结构蛋白质组学

结构研究对蛋白质功能、药物发现的蛋白质目标的可药性和药物设计产生重要的洞察力。

食品科学

食品安全和质量控制,过敏原检测和提高食品的营养价值。

蛋白质-蛋白质相互作用

研究蛋白质之间如何相互作用,哪些蛋白质相互作用,以及何时何地相互作用。

古蛋白组学

研究古代蛋白质以进一步了解进化和考古。


服务流程



实验流程

不同样品提取的蛋白质进行定量,取等量蛋白分别进行胰酶酶解,之后纯化的各组肽段分别做LC-MS/MS分析;采用特定软件检索原始质谱数据,解析出不同样品中各个肽段的定量信息,进而获得蛋白质在不同样品中的定性和定量信息。


① 蛋白提取 -- ② 脱盐 -- ③ 解旋 -- ④ 去杂质 -- ⑤ 高分辨质谱检测数据 -- ⑥ 数据分析

注:送样要求请联系陈博士获取!


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实验案例


组织样品案例:



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服务承诺

提供专业的服务人员,并保证24小时内响应。

以研究为首任,以客户为中心,凭借技术平台,坚持优质服务,为您提供全方位的实验解决方案!

设立内部质控严格把控质量关,与客户全程互动沟通,服务流程可监督,杜绝任何形式的不端行为。





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